Caracterización bioquímica y detección molecular de bacterias en aguas de producción de petróleo

Abstract

Debido a la importancia estratégica que representan las operaciones en la Faja Petrolífera del Orinoco para el desarrollo de la nación, en la industria petrolera es fundamental orientar los esfuerzos en la investigación y el desarrollo de tecnologías para la explotación de crudos pesados y extrapesados, para la remediación de ambientes impactados por hidrocarburos y para la preservación de la infraestructura. Estas tecnologías incluyen los procesos biotecnológicos que involucran el uso de bacterias o sus metabolitos. Uno de los productos de origen biológico mayormente utilizados en las operaciones de la industria petrolera son los biosurfactantes, principalmente del tipo ramnolipido producido a partir de la bacteria Pseudomonas aeruginosa. A fin de establecer una estrategia para conocer los grupos mayoritarios de bacterias en ambientes relacionados con pozos petroleros y detectar bacterias de interés biotecnológico, se seleccionó un área de estudio modelo de acuerdo a su criticidad por el alto contenido de microorganismos. Por técnicas basadas en cultivos, se estudiaron las características morfológicas y bioquímicas de las bacterias presentes en el área, su capacidad para formar biopelículas y para producir biosurfactantes. Para la identificación genética de las bacterias se realizó la amplificación por PCR del ADNr 235, su secuenciación, alineamiento y comparación con las bases de datos disponibles y se diseñó un método basado en huellas moleculares por análisis de restricción de este gen, una metodología molecular que puede ser estandarizada y aplicada de manera rápida y confiable para detectar los grupos bacterianos mayoritarios que habitan en ambientes de diferentes áreas operacionales de la industria petrolera, tanto para conocer si representan riesgos en la integridad de estructuras y procesos, como para obtener bacterias con uso potencial en procesos biotecnológicos. la técnica de PCR-RFLP diseñada y usada en este estudio, resultó útil para identificar y diferenciar los grupos mayoritarios de bacterias presentes en ambientes relacionados con la producción de petróleo como son las bacterias de los géneros Pseudomonas y Bacillus.