Estudio de la variabilidad genética intraespecífica en aislados de Mycosphaerella fijiensis recolectados en la zona sur del Lago de Maracaibo

Abstract

El objetivo de este trabajo fue estudiar la variabilidad genética intraespecífica en Mycosphaerella fijiensis a partir de aislados obtenidos de muestras recolectadas en plantaciones de cultivo de bananas afectadas con sigatoka negra, en regiones escogidas de la zona Sur del Lago de Maracaibo, específicamente en el sector Hoya Grande Zona Húmeda (HGZH) y Hoya Grande Zona Seca (HGZS). Para llevar a cabo este estudio, la etapa primordial para la determinación de variabilidad genética fue la obtención de cultivos monoascospóricos de cada uno de los veinte aislados que componen el muestreo jerárquico de Mycosphaerella fijiensis para ambas zonas del sector Hoya Grande. La obtención de este banco de aislamientos ascospóricos de Mycosphaerella fijiensis es crucial, debido a que cada aislado es el portador de un contenido genómico único, que representa y corresponde a un clon genéticamente uniforme de una célula fúngica individual. Estos veintes aislados se agrupan en cinco niveles jerárquicos, formados por cuatro miembros. Se utilizó el PCR y PCR-RAPDs para identificar molecularmente a los aislados de M. fijiensis y detectar polimorfismo genético en el ADN del hongo. La identificación molecular permitió observar el resultado esperado, que se correspondió con el tamaño del producto a amplificar de 1kb. El polimorfismo determinado dentro de cada muestreo con el paquete NTSYS fue limitado, debido a que se utilizó un número reducido de “primers”; sin embargo, se logró observar diferencias génicas a nivel de zona de muestreo.

The main goal of this work was to study the intraespecific genetic variability of Mycosphaerella fijiensis isolates collected from comercial banana orchards south to Lake of Maracaibo, in the areas known as Hoya Grande Zona Húmeda (HGZH) and Hoya Grande Zona Seca (HGZS). To attain our objectives of establishing the genetic variability of the fungus we focused our efforts on the generation of monoascosporic cultures from each of twenty different isolates that comprise the hierarchic sampling of M. fijiensis from both geographical areas. Obtaining pure monoascosporic cultures is fundamental for this type of análisis since every isolates must harbor a unique genomic unit which represents a single fangal cell. All twenty isolates were grouped in five hierarchic levels, each of them comprised by tour members. PCR and RAPD análisis were used to molecularly identify all M. fijiensisisolates and to detect molecular polymorphisms in the fangal DNA. Molecular identification allowed testing the expected results by the generation of an amplified band 1 Kb. Long. Polymorphism, as established using the NTSYS software, was low since a very few primers were used to perform the análisis; genetic variations, however, were observed between the geographical sampling areas.