EVALUACIÓN MOLECULAR DE LA RESISTENCIA DE VARIEDADES DE PAPA A Phytophthora infestans EN REPÚBLICA DOMINICANA

Abstract

La identificación de genes de interés agronómico se facilita con el uso de marcadores moleculares ligados a ellos que permiten seleccionar genotipos con rasgos de interés. Con el objetivo de identificar materiales de papa (Solanum tuberosum) con genes de resistencia al tizón tardío (Phytophthora infestans) fueron utilizadas cinco combinaciones de cebadores de marcadores moleculares SCAR (sequence characterized amplified region). Se tomaron muestras de tubérculos de doce fincas del municipio Constanza, tres de la provincia de San José de Ocoa y siete de diferentes genotipos disponibles en tiendas comerciales. A partir de esos tubérculos se establecieron 116 plántulas in vitro y se tomaron muestras de hojas para extracción de ADN. Éste fue amplificado por PCR y visualizado mediante electroforesis en geles de agarosa al 2 %. Los geles fueron digitalizados y posteriormente analizados por presencia y ausencia de amplicones, así como por comparación del tamaño de las bandas observado versus esperado. Se presentaron fragmentos polimórficos y monomórficos para el total de cultivares en cada marcador estudiado, los cuales correspondieron a alelos relacionados a la resistencia a P. infestans. El marcador GP179 presentó un fragmento monomórfico de 570 pb. En PrP1 los alelos resultantes guardaron algo de relación con las variedades estudiadas. R1, fragmento característico del gen R1 de resistencia, se presentó sólo en el CPC336 (control positivo), mientras que CosA estuvo presente en una muestra de la variedad Granola y en el CPC336. Es el primer informe del uso de este tipo de marcadores para la detección de resistencia a enfermedades que se señala en República Dominicana.

The identification of agronomical interesting genes is facilitated by the use of molecular markers linked to them that allow the selection of genotypes with the traits of interest. With the aim to identify potato materials (Solanum tuberosum) with late blight (Phytophthora infestans) resistance genes, five combinations of SCAR (sequence characterized amplified region) molecular marker primers were used. Tuber samples were collected from 12 farms of Constanza county, 3 of San José de Ocoa and seven varieties available at commercial stores. From these tubers, 116 in vitro plantlets were established, taking leave samples for DNA isolation. The DNA was amplified by PCR and visualized using electrophoresis on 2% agarose gels. The gels were digitalized and later analyzed by the presence and absence of amplicons, as well as comparing the observed versus the expected size of the bands. Polymorphic and monomorphic fragments were obtained for the total of cultivars in each studied marker; which corresponded to alleles related to the resistance to P. infestans. Marker GP179 yielded a monomorphic fragment of 570 bp. For PrP1 the resulting alleles showed some relationship with the studied varieties. R1, a characteristic fragment of the R1 resistance gene, was found only in the CPC336 (positive check), whereas CosA was present in a Granola variety sample and in CPC336. This is the first report of using this type of markers for detection of disease resistance that is indicated in the Dominican Republic.